Agrivalys71 effectue des analyses en immunologie, parasitologie, bactériologie, biologie moléculaire sur bovins, ovins, caprins, porcins, volailles et végétaux.
Notre laboratoire est spécialisé dans les analyses en santé animale et végétale :
Nous intervenons lors de :
Maladies réglementées soumises à des contrôles réguliers par les organismes de contrôle sanitaire (DDPP, GDS).
Maladies dont le contrôle n'est pas obligatoire mais les éleveurs peuvent effectuer des contrôles réguliers de façon volontaire (en cas de suspicion par exemple).
Maladies décelées via le diagnostic d'un vétérinaire.
Maladies réglementées ou non, contrôlées dans le cadre de l'épidémio-surveillance départementale et de la veille sanitaire, en partenariat avec le réseau national SAGIR.
Maladies réglementées ou non, soumises à des contrôles officiels réalisés dans le cadre d'exportation d'animaux vivants selon le certificat sanitaire du pays importateur.
Que ce soit pour le pôle santé animale ou végétale le process est le suivant :
Les méthodes ELISA (Enzyme Linked Immunosorbent Assay) permettent la détection d'anticorps, d'antigènes, d'haptènes à partir d'échantillons d'origine animale ou végétale.
Les analyses sont effectuées à l'aide de trousses de réactifs (Kits) distribuées par différents fournisseurs.
Les particularités propres à chaque méthode ELISA sont détaillées dans les protocoles accompagnant les kits commerciaux.
L'intensité de la coloration finale est mesurée à l'aide d'un spectrophotomètre, elle est fonction directe (ELISA indirect) ou inverse (ELISA compétition) de la concentration en substance spécifique recherchée présente dans l'échantillon.
Domaines d'application :
Selon les méthodes, les analyses sont réalisables sur sang total, sérums individuels ou en mélanges, plasma, lait, extraits végétaux (feuilles, bois, racines, pseudo-tronc...). La méthode peut être réalisée soit manuellement, soit à l'aide d'automates.
Les analyses sont effectuées dans le but soit de poser un diagnostic individuel, soit dans le cadre de prophylaxie volontaire ou obligatoire, ou encore dans le cadre d'analyses officielles.
La réaction PCR (Polymerase Chain Reaction) permet d'amplifier à l'aide d'une enzyme, l'ADN polymérase, une région spécifique d'un acide nucléique donné afin d'en obtenir une quantité suffisante pour le détecter et l'étudier.
Pour ce faire, une série de réactions permettant la réplication d'un extrait d'ADN double brin est répétée en boucle. Ainsi, au cours de la réaction PCR, les produits obtenus à la fin de chaque cycle servent de matrice pour le cycle suivant, l'amplification est donc exponentielle au tout début.
La PCR se déroule en 3 étapes :La PCR en temps réel permet de détecter des amplicons (fragment d'ADN généré par la PCR) au fur et à mesure de la réaction, par émission d'un signal fluorescent proportionnel à la quantité d'amplicons générée.
Au laboratoire, pour le suivi de la réaction d'amplification, on utilise des sondes de type Taqman ® marquées par différents fluorophores (FAM, VIC, NED, CY5...) permettant de détecter plusieurs valences simultanément (PCR multiplex).
Pour les génomes à ARN, une étape préliminaire de RT (Reverse Transcription) est indispensable. Il s'agit de synthétiser à partir d'une matrice ARN un ADN complémentaire qui pourra servir de matrice à la PCR. Cette réaction est catalysée par des enzymes : Reverse Transcriptases.
Elle peut être précédé par une étape de dénaturation si nécessaire (ARN double brin).
La technique PCR est basée sur la mise en évidence directe du matériel génétique des microorganismes pathogènes c'est-à-dire soit l'ADN (Chlamydophila, Coxiella, Pasteurella, Mycoplasma...) soit l'ARN (virus de la FCO, du BVD, virus respiratoires) à partir d'échantillons « acellulaires » (sang total, sérum, plasma, surnageant de culture cellulaire) ou « cellulaires » (lait, organes, écouvillons, liquide d'ATT, bouillons de culture, fèces).
Elle peut être qualitative, relative à un matériau au seuil d'interprétation ou quantitative.